Trong các phòng thí nghiệm sinh học phân tử, chất lượng DNA đầu vào quyết định trực tiếp đến độ tin cậy của PCR, giải trình tự gen (DNA Sequencing), giải trình tự thế hệ mới (NGS) và nhiều kỹ thuật phân tích khác. Chỉ cần DNA bị nhiễm protein, phenol hoặc có nồng độ không phù hợp, toàn bộ quy trình xét nghiệm có thể phải thực hiện lại.
Máy đo quang phổ MicroBio-3 giúp kỹ thuật viên đánh giá nhanh nồng độ và độ tinh sạch của DNA chỉ với lượng mẫu rất nhỏ. Điều này giúp tiết kiệm mẫu quý, giảm rủi ro trong các xét nghiệm ADN và nâng cao hiệu quả vận hành phòng thí nghiệm.
Tại sao kết quả giải trình tự gen hoặc PCR lại thất bại dù quá trình tách chiết DNA thực hiện đúng quy trình?
Không phải mọi thất bại đều đến từ bước tách chiết. Trên thực tế, nhiều mẫu DNA vẫn được tách đúng quy trình nhưng không đáp ứng yêu cầu cho các bước phân tích tiếp theo.
Một số nguyên nhân phổ biến gồm:
- DNA bị phân mảnh do bảo quản không phù hợp.
- Còn dư protein hoặc RNA.
- Tồn dư phenol, ethanol hoặc muối từ bộ kit tách chiết.
- Nồng độ DNA quá thấp hoặc quá cao.
- DNA bị suy giảm sau nhiều lần đông lạnh và rã đông.
Trong thực tế, chỉ số A260/A280 thường được sử dụng để đánh giá mức độ tinh sạch của DNA.
DNA tinh sạch thường có tỷ lệ A260/A280 khoảng 1,8. Giá trị thấp hơn có thể cho thấy mẫu còn nhiễm protein, trong khi tỷ lệ A260/A230 thấp thường phản ánh sự hiện diện của muối hoặc các hóa chất hữu cơ.
Nếu bỏ qua bước kiểm tra này, kỹ thuật viên có thể đưa mẫu không đạt chất lượng vào PCR hoặc giải trình tự, dẫn đến kết quả khuếch đại yếu, xuất hiện nhiều tín hiệu nền hoặc thất bại hoàn toàn.
Hệ lụy nghiêm trọng khi phải hủy bỏ cả đợt xét nghiệm ADN đắt đỏ vì dùng phải mẫu DNA bị đứt gãy hoặc tàn dư hóa chất
Chi phí của một đợt giải trình tự ADN hoặc NGS có thể lên tới hàng triệu đồng cho mỗi mẫu, chưa kể thời gian chuẩn bị, hóa chất và nhân lực.
Nếu chất lượng DNA không được kiểm tra trước, phòng thí nghiệm có thể gặp nhiều rủi ro:
- Phải tách chiết lại toàn bộ mẫu.
- Lãng phí kit PCR và hóa chất đắt tiền.
- Kéo dài thời gian trả kết quả.
- Mất mẫu quý trong nghiên cứu hoặc y học.
- Gia tăng chi phí vận hành phòng thí nghiệm.
Đối với các mẫu sinh thiết, mẫu pháp y hoặc mẫu bệnh phẩm hiếm, lượng DNA thường rất hạn chế. Nếu sử dụng toàn bộ mẫu cho phản ứng PCR rồi mới phát hiện DNA không đạt chất lượng thì gần như không còn cơ hội thực hiện lại.
Vì vậy, kiểm tra DNA trước khi tiến hành các bước phân tích chuyên sâu đã trở thành quy trình thường quy tại nhiều phòng nghiên cứu, trung tâm xét nghiệm và đơn vị giải trình tự.
Đánh giá nhanh độ tinh sạch và xác định chính xác nồng độ DNA thể tích micro nhờ công nghệ đo quang phổ MicroBio-3
Máy đo quang phổ MicroBio-3 là máy đo quang phổ thể tích micro được thiết kế cho phân tích acid nucleic, protein và dung dịch tế bào. Thiết bị cho phép đánh giá DNA nhanh mà không cần pha loãng mẫu trong nhiều trường hợp.
Một số thông số nổi bật của MicroBio-3 gồm:
- Dải bước sóng: 200–800 nm.
- Lượng mẫu cần đo: Chỉ từ 0,5–2 µL.
- Thời gian đo: Dưới 5 giây.
- Nguồn sáng: Đèn Xenon Flash tuổi thọ cao.
- Detector: CCD tuyến tính 2048 phần tử.
- Dải đo DNA (dsDNA): 2–4500 ng/µL.
Khi đo DNA, thiết bị tự động:
- Xác định nồng độ DNA.
- Tính tỷ lệ A260/A280.
- Tính tỷ lệ A260/A230.
- Hiển thị phổ hấp thụ để phát hiện bất thường của mẫu.
Nhờ đó, kỹ thuật viên có thể quyết định ngay mẫu nào đủ điều kiện để thực hiện PCR hoặc giải trình tự mà không phải chờ thêm các bước kiểm tra khác.
Một ưu điểm đáng chú ý là mẫu sau khi đo vẫn có thể thu hồi để tiếp tục sử dụng trong các phân tích tiếp theo.
Phương pháp đo mẫu thể tích micro để bảo toàn tối đa lượng DNA quý hiếm cho các bước phân tích chuyên sâu
Đối với các mẫu có giá trị cao như:
- DNA từ sinh thiết.
- DNA cổ.
- DNA pháp y.
- DNA vi sinh vật khó nuôi cấy.
- DNA tách từ tế bào đơn.
việc tiết kiệm từng microlit mẫu là rất quan trọng.
MicroBio-3 chỉ cần 0,5–2 µL cho mỗi lần đo nên gần như không ảnh hưởng đến lượng mẫu còn lại. Thiết bị cũng không yêu cầu sử dụng cuvette, giúp giảm thao tác và hạn chế thất thoát mẫu.
Một quy trình kiểm tra DNA điển hình gồm:
- Tách chiết DNA.
- Làm sạch mẫu nếu cần.
- Đo nồng độ và độ tinh sạch bằng MicroBio-3.
- Đánh giá chỉ số A260/A280 và A260/A230.
- Tiến hành PCR, qPCR hoặc giải trình tự khi mẫu đạt yêu cầu.
Quy trình này giúp giảm đáng kể nguy cơ phải lặp lại xét nghiệm, đồng thời tối ưu chi phí hóa chất và thời gian xử lý.
Kết luận
Kiểm tra chất lượng DNA trước khi thực hiện PCR hoặc giải trình tự gen giúp giảm nguy cơ sai sót, tiết kiệm thời gian, hóa chất và bảo toàn những mẫu DNA có giá trị. Với khả năng đo nhanh, chỉ cần lượng mẫu rất nhỏ và cung cấp đầy đủ các chỉ số đánh giá độ tinh sạch, máy đo quang phổ MicroBio-3 là giải pháp phù hợp cho các phòng thí nghiệm nghiên cứu và xét nghiệm ADN.
Liên hệ ngay với chúng tôi để được tư vấn thêm về sản phẩm!
Thương hiệu BEL Engineering đã có mặt trên thị trường Việt Nam trên 10 năm và không ngừng phát triển. Đội ngũ sửa chữa, hiệu chuẩn, bảo trì chuyên nghiệp. Liên hệ ngay: 02822209913
